Sütün ekşimesinin ana sebebi, içinde bulunan bazı bakterilerin sütü bozmaya başlamasıdır. Süt sıcak ortamda bakteri üretmeye başlar. Bu bakteriler, sütün içinde asit üretir ve sütün tadı ekşir. Yanlış saklama teknikleri, temiz olmayan kaplarda tutulması veya ağzının açık bırakılması da ekşimeyi hızlandırır.